Poslední změna: 27. 10. 2012

Aktuálně

27.10. 2012 Přidána položka SegmentationTool do sekce "Co jsem vytvořil", zprovozněn odkaz na diplomovou práci

16. 3. 2012 Mírně upraveno CV

22. 2. 2012 Přidána stránka o izraelských lidových tancích

25. 1. 2012 Přidáno CV

6. 1. 2012 Zprovozněny odkazy na kamarády a známé

2. 1. 2012 Upraveny osobní informace o mé osobě a vytvořen rozcestník o korespondenčních seminářích

26. 8. 2011 Zprovozněny odkazy k Rku

1. 5. 2011 Nový design stránek, plánuju postupně zprovoznit přeškrtnuté odkazy

Archiv aktualit

Kdo jsem a co dělám

  • Studium
  • Jsem doktorand na ZOI ÚTIA AV, kde se věnuji digitálnímu zpracování obrazu.

    Od října 2011 jsem rovněž vědeckým pracovníkem na Jihočeské univerzitě (na částečný úvazek).

    V minulých letech jsem vystudoval bakalářský obor Obecná fyzika a navazující magisterský obor Matematické a počítačové modelování ve fyzice a technice na Matematicko-fyzikální fakultě Univerzity Karlovy.

  • Výuka
  • LS 2010/2011 cvičení Matematická analýza II NMAF042. Stránky cvičení.

    ZS 2010/2011 jsem cvičil Matematickou analýzu I NMAF041. Stránky cvičení.

  • Kontakt
  • Jindřich Soukup
    Mail: jindra<zavinac>matfyz<tecka>cz
    ICQ: 646 498 595

  • Zájmy
  • Rád zpívám a hraju na kytaru. Sportuju (frisbee, badminton, lezení, slackline ...), rád tancuju (argentinské tango, standard, latinu, ...) a rád jezdím na vodu.

  • Stručný životopis
  • Co jsem vytvořil

  • SegmentationTool
  • Jde o program, který má za cíl označit, kde na obrázku je pozadí a ke se nacházejí buňky. Pracuje s časosběrnými snímky získanými pomocí mikroskopu na bázi fázového kontrastu či bright field. Program (zip, 1,8MiB) byl vytvořen v Matlabu a ke svému běhu potřebuje knihovnu MCRInstaller.exe (cca 200 MiB). Anglický manuál, český manuál.

  • Bakalářská práce
  • Téma mé bakalářské práce bylo "Molekulárně-dynamické simulace proteinových struktur a úzce souviselo s hledáním léků proti virovým onemocněním (HIV, hepatitida typu C, ...). Můžete si prohlédnout celou práci (pdf, 3,5 MiB) či zjednodušenou verzi vysvětlující základní myšlenky (pdf, 230 kiB).

  • Videa fyzikálních jevů
  • V bakalářské práce jsem se naučil simulovat jevy na fyzikální úrovni pomocí molekulární dynamiky. V rámci akce Schola ludus jsem pod vedením Martiny Roeselové vytvořil několik videí, které by se daly využít například při výuce fyziky, chemie či biologie. Vytvořil jsem i návod (anglická verze), jak taková videa vyrobit.

  • Diplomová práce
  • Téma mé diplomové práce je Studium počátečních fází růstu kovových vrstev metodami počítačové fyziky. Veškeré další informace o ní naleznete zde.

  • Jak si představit různé matematické pojmy
  • Z matfyzu mám zkušenost, že matematika se učí do velké míry technicky a chybí informace o tom, k čemu dané učivo je, jak by se dalo využít v praxi, případně jak si dané pojmy představit. Pokusil jsem se proto vytvořit nějaký materiál, který by toto obsahoval.

  • Matematické a fyzikální hříčky
  • V letech 2005 – 2009 jsem organizoval korespondenční seminář M&M. Na soustředěních jsme pravidelně s účastníky dělali malé projekty týkající se matematiky, fyziky či informatiky. Materiály, nápady, úlohy a další věci najdete na této stránce.

  • Informatika, sluchově postižení
  • V letech 2006 - 2009 jsem učil na částečný úvazek informatiku na Střední škole pro sluchově postižené v Radlicích. Materiály týkající se výuky jsou zde, stránka o sluchově postižených tady.

  • Zpěvníky
  • Před lety jsem na internetu našel výborný program na tvorbu zpěvníků. Spolu s ním byla na stránkách i databáze s přibližně 10000 písničkama, která ale později musela být ze stránek stažena. Kompletní set si můžete stáhnout zde (zip, 6,8 MiB), ukázka programem vytvořeného zpěvníku je tady (pdf, 180 kiB).

    Studium na matfyzu, odkazy

  • Můj pohled na bakalářské studium fyziky
  • Můj pohled na magisterskě studium a matematické modelování
  • Odkazy podle témat
  • Co se nevešlo jinam

  • Staré stránky
  • Fotky
  • Odkazy - kamarádi
  • Odkazy - ostatní
  • Izraelské lidové tance